Filtros de ADN ambiental de Waterra para el muestreo de agua

Los filtros de ADN ambiental de Waterra se fabrican en nuestras instalaciones de sala limpia en Calgary, Alberta, Canadá. Cada filtro se embolsa individualmente con dos tapas de extremo para contener un tampón para la preservación de la muestra. El medio filtrante está disponible en 5 tamaños de poro diferentes, de 0,1 a 5 micras, y se ofrece en formatos de 300 y 600 centímetros cuadrados.

Información general

Existe interés en consultar algunas masas de agua superficiales sobre la presencia de ciertos organismos. Tal vez se haya detectado una especie invasora y se desee determinar su presencia. Las masas de agua superficiales, como estanques, arroyos y lagos, se pueden muestrear utilizando filtros de ADN ambiental de Waterra bombeando agua de esa masa a través del filtro. El ADN en el agua es capturado por el filtro y se puede conservar para su extracción en un entorno de laboratorio.

La “e” en ADN ambiental significa ambiental y “ADN” es ácido desoxirribonucleico, conocido por ser el componente básico de la vida. El ADN está contenido en las células de todos los organismos vivos y se desprende al medio ambiente de muchas maneras. El organismo puede vivir o haber vivido en la masa de agua o en la zona de captación, estar de paso o haber sido transportado. Independientemente de cómo llegó allí, si está en el agua, existe la posibilidad de que el ADN esté en la muestra de agua procesada a través del filtro de ADN ambiental.

Una ventaja de utilizar los filtros de ADN ambiental de Waterra es que la gran superficie del filtro (ya sea de 300 cm² o 600 cm²) permite que pasen grandes volúmenes de agua. Las muestras de hasta 100 litros o más, dependiendo de la turbidez del agua, aumentan las probabilidades de capturar ADN ambiental de la especie objetivo. El procesamiento de muestras grandes se vuelve un desafío a menos que se utilice una bomba.

Técnicas de recolección de muestras:

Simplemente conecte un filtro de ADN ambiental de Waterra al tubo de su bomba de succión y coloque el extremo de entrada del filtro en la masa de agua que se va a muestrear. Haga pasar el volumen designado de agua a través del filtro desechable en línea, capturando partículas, incluido el ADN ambiental, en el filtro.

Waterra ofrece bombas peristálticas que funcionan con baterías y que fueron diseñadas para su uso en el campo. Recomendamos que el tubo peristáltico se conecte a otra longitud de tubo de LDPE o HDPE que, a su vez, tenga un filtro instalado en el extremo. Al conectar el filtro en el extremo de entrada, la longitud del tubo de PE y el propio tubo peristáltico no entran en contacto con el ADN ambiental capturado. Esto mitiga la necesidad de cambiar el tubo para cada muestra.

Si esto no es práctico, entonces el filtro se puede insertar entre el tubo peristáltico y una longitud desechable de tubo que debe cambiarse después de cada ubicación de muestra. Waterra proporciona un sistema completo de bomba, tubo y filtros de ADN ambiental para dicho muestreo.

Una vez que se procesa el volumen deseado, el filtro se drena cuidadosamente desde el lado de salida para no perder las partículas capturadas en el filtro. Normalmente, se añade una solución tampón para preservar el ADN ambiental, aunque la congelación y el secado son métodos de conservación alternativos. (Tenga en cuenta que Waterra no proporciona soluciones tampón). Coloque firmemente una tapa de extremo de tampón en el lado de entrada. Llene el filtro con el tampón deseado para preservar el ADN y coloque la segunda tapa de extremo de tampón para atrapar el tampón en el filtro. Los tapones de extremo de Waterra retienen el tampón y el ADN ambiental para su posterior procesamiento. Los tapones de extremo se proporcionan en cada bolsa de filtro de ADN ambiental sellada.

Escribimos un artículo aquí publicado en la revista Environmental Science & Engineering como una introducción al concepto de muestreo de ADN ambiental con especial referencia a un tratado sobresaliente sobre el tema “Environmental DNA for Biodiversity Research and Monitoring” de Pierre Taberlet, Aurélie Bonin, Lucie Zinger y Eric Coissac publicado por Oxford University Press en 2018.

Método 1 para insertar el tampón

Método 2 para insertar el tampón. Algunos investigadores lo encuentran más eficaz.